二元液相色譜儀工作方式：雙泵并聯(lián)，可同時有兩個流動相，按照預先設定的配比進入，再高壓下進行混合，混合配比更準確，不易產生氣泡，不用為了轉換流動相而反復清洗，提高了工作效率。同時可以做梯度洗脫，當待測樣品成分復雜，用一個固定的流動相配比無法將樣品中成分*分開時，就需要用到梯度洗脫，在同一個分析過程中由儀器自動改變流動相配比，將樣品中前次無法分離的物質進行洗脫，在同一譜圖中得到分開的峰的效果。有助于提高分析準確性，避免遺漏重要物質的檢測。

    四元液相色譜儀工作方式：可同時有四個流動相進入流路，按照預先設定的配比進行混合，由于在常壓下混合所以較易產生氣泡，因此必須配備在線脫氣機，可消除氣泡影響?？梢宰鎏荻认疵?，在儀器上進行設定之后，在同一樣品分析工程中，相隔一段時間后，按照用戶設定的配比自行改變流動相配比，將樣品中所有組分分離開來，有助于提高分析準確性。做簡單的分析，一般性的化合物用二元的系統(tǒng)就很好，如果做蛋白類，多肽等半制備或梯度洗脫還是四元系統(tǒng)方便，但需配在線脫氣機。

    二元高壓混合和四元低壓混合的一個重大區(qū)別就是前者進入輸液泵后立即進行混合，而后者是進泵以后慢慢混合，有的還要過一混合器，混合不但置后，而且效果明顯不如前者。二元的價格比四元的貴，兩種類型的液相色譜儀在性能上各有優(yōu)缺點。